Cash in funds è un'espressione molto formale che si usa appunto nei contratti per indicare che il pagamento deve essere effettuato attraverso una modalità che prevede un trasferimento di liquidi immediato, che non significa necessariamente in contanti (ad es. carta di credito, bank transfer, etc) Io tradurrei con "contestualmente", quindi
Il pagamento dell'acquirente dovrà essere contestuale all'emissione della fattura.