Por regla, la frase no señala un territorio que pueda considerarse una nación, estado, ciudad, etc., sino que hace referencia a la situación de cierta área de un país.

A mi parecer, el uso de mayúsculas proviene de la costumbre del periodismo en idioma inglés de construir acrónimos para ahorar espacio.

Escribirlo en mayúsculas sería lo mismo que decir "la Zona Afectada por el Huracán".